１９９９年長野リーグ実業団１部２部男子組み合わせ
| １．シメオ精密（前回優勝） | ２．新光電気 |
| ３．ｾｲｺｰｴﾌﾟｿﾝ諏訪（ＳＥ諏訪） | ４．松本市役所 |
| ５．長野県庁 | ６．ＪＲ東日本 |
| ７．キッセイ薬品工業 | ８．ｾｲｺｰｴﾌﾟｿﾝ広丘（ＳＥ広丘）（1部より昇格） |
実業団1部リーグ
| （1組） | （２組） |
| １．ＴＤＫ（長野リーグより降格） | １．山洋電気 |
| ２．長野日本無線 | ２．セイコーエプソン富士見（ＳＥ富士見） |
| ３．シナノケンシ | ３．信大テニスクラブ |
| ４．セイコーエプソン松塩（ＳＥ松塩） | ４．セイコーエプソン豊科（ＳＥ豊科） |
| ５．日本ユニシス | ５．富士電機松本 |
| ６．オリンパス光学辰野（2部より昇格） | ６．八十二銀行 |
| ７．日置電機（2部より昇格） | ７．帝国ピストンリング（2部より昇格） |
| ８．石川島芝浦機械（2部より昇格） | ８．軽井沢町役場（2部より昇格） |
実業団２部リーグ
| （1組） | （２組） |
| １．１部２組８位 | １．１部１組８位 |
| ２．東京特殊電線（東特） | ２．双信電機 |
| ３．樫山工業 | ３．ミヨタ |
| ４．３部上がり② | ４．上田市役所 |
| ５．３部１組１位 | ５．３部２組１位 |
| （３組） | （４組） |
| １．1部２組７位 | １．１部１組７位 |
| ２．信濃電気 | ２．セイコーエプソン松本南（ＳＥ松本南） |
| ３．長野県教職員組合 | ３．セイコーエプソン諏訪南（ＳＥ諏訪南） |
| ４．松下電送システム | ４．セイコーエプソン光学（ＳＥ光学） |
| ５．３部３組１位 | ５．３部４組１位 |
| （５組） | （６組） |
| １．1部２組６位 | １．１部１組６位 |
| ２．シメオ精密小諸 | ２．キッセイ薬品穂高 |
| ３．松本市水道局 | ３．松本合同庁舎 |
| ４．日信工業 | ４．日立製作所小諸 |
| ５．３部５組１位 | ５．３部上がり① |
１９９９年長野リーグ実業団３部男子組み合わせ
実業団３部リーグ
| （1組） | （２組） |
| １．日精樹脂 | １．泉精器 |
| ２．ソニーデジタルプロダクツ | ２．ＪＤＬ松本 |
| ３．マルヤス機械 | ３．ＧＡＣ |
| ４．シチズン精機 | ４．岡谷市役所 |
| ５．オリンパス光学伊那 | ５．電算 |
| （３組） | （４組） |
| １．長野沖電気 | １．サーキットデザイン |
| ２．日本電熱 | ２．上條メディカル |
| ３．高見沢サイバネティックス | ３．アピックヤマダ |
| ４．長野銀行 | ４．石川島汎用機械 |
| ５．昭和電工塩尻 | ５．塩尻市役所 |
（５組）
新規チーム及び再登場チームによるリーグ戦（もしくは変則トーナメント）
再登場チーム（早く復帰してください）
１・三協精機 ２・ツガミ ３・新村
４・山形村役場 ５・諏訪市役所
新規チーム（競技・総務から案内を出してください）
京セラ・長野市役所・ハーモニックドライブ・日東光学・上田日本無線・平和時計
３部１組から４組に欠員が生じた場合再登場チームの番号が若いチームより補填される。
２部チームに欠員が生じた場合３部より以下のように補填される。
| ２部上がり数 | ５組出場数 | １組 | ２組 | ３組 | ４組 | １－４組 | ５組 |
| ６ | ７以下 | １位 | １位 | １位 | １位 | １チーム | １位 |
| ６ | ８以上 | １位 | １位 | １位 | １位 | ２チーム | |
| ７ | ５以下 | １位 | １位 | １位 | １位 | ２チーム | １位 |
| ７ | ６－１２ | １位 | １位 | １位 | １位 | １チーム | ２チーム |
| ７ | １３以上 | １位 | １位 | １位 | １位 | ３チーム | |
| ８ | ５以下 | １位 | １位 | １位 | １位 | ３チーム | １位 |
| ８ | ６－１０ | １位 | １位 | １位 | １位 | ２チーム | ２チーム |
| ８ | １１－１５ | １位 | １位 | １位 | １位 | １チーム | ３チーム |
| ８ | １６以上 | １位 | １位 | １位 | １位 | ４チーム |